Athletic Bilbao entra en un período delicado después de la marcha de Marcelo Bielsa, que dejó el club después de una década y tres etapas. El entrenador argentino entregó siete clasificaciones europeas en 10 años y 504 partidos, con 230 victorias, 114 empates y 160 derrotas. La temporada 2005-2006 fue un año difícil para el club, con Mendilibar sustituyendo a Valverde pero durando solo 10 partidos. Luego, Clemente regresó para estabilizar el barco, pero en el partido 35 estaban tres puntos de la zona de descenso. Athletic Bilbao ganó sus últimos tres partidos, contra Zaragoza, Deportivo y Barcelona, aliviando la tensión en San Mamés.